Чл. 26. (1) Агенцията е организирана в дирекции и отдели. В дирекциите и отделите с акт на председателя на Агенцията могат да се създават и други звена.

(2) Наименованието, вътрешната организация и функциите на звената се определят с акт на председателя на Агенцията.

(3) Звената осъществяват функциите и дейностите, посочени в чл. 7 и 8, в следните направления:

1. (доп. - ДВ, бр. 51 от 2020 г.) разузнавателна дейност и контраразузнавателното ѝ обезпечаване на и извън територията на страната, включително провеждане на разузнавателни операции;

2. информационно-аналитична дейност;

3. управление на човешките ресурси;

4. правнонормативна дейност;

5. сигурност и защита на класифицираната информация;

6. международно сътрудничество;

7. оперативен отчет и архив;

8. финансово-счетоводна дейност;

9. стопанска дейност;

10. охранителна дейност;

11. управление при кризи и отбранително-мобилизационна подготовка;

12. информационно-техническо обслужване и компютърни системи;

13. вътрешен одит;

14. вътрешен административен контрол.