Чл. 6. (1) Агенцията се ръководи и представлява от председател, който се определя с решение на Министерския съвет.
(2) При осъществяване на своите функции председателят на агенцията се подпомага от заместник-председател.
(3) Министър-председателят сключва, изменя и прекратява договорите с председателя и заместник-председателя.